Навчально-науковий інститут механотроніки та систем менеджменту протягом багатьох років здійснює активну науково-дослідну діяльність, головним напрямком якої є велика допомога виробництву в підвищенні кількісних і якісних показників, в підтримці вітчизняних виробників. Ця допомога базується, в першу чергу, на наукових здобутках, які отримали вчені інституту як в напрямі удосконалення сільськогосподарської техніки, так і в напрямі її використання.
Останніми роками науковий потенціал інституту був зосереджений на виконанні комплексної теми, окремі складові якої визначили напрямки робіт на кафедрах інституту, де, в свою чергу, були конкретизовані завдання з урахуванням діючих наукових шкіл та багаторічних досягнень конкретних виконавців.
В наведеній таблиці подана комплексна тема інституту та її розділи, що складають тематику кафедральних робіт.
Розробка і впровадження у виробництво машинно-технологічних систем для механізованого виробництва с. г. продукції на основі енергозберігаючих, екологічно-безпечних технологій і технічних засобів для різних форм господарювання.